BIO127 Anvendt Bioinformatikk

Innhold og oppbygning

Bioingeniørfaget har i det siste tiåret i økende grad tatt i bruk informatikk som verktøy i medisinske laboratorieanalyser. Emnet skal gi en grunnleggende innføring i databehandling og dataanalyser med hovedvekt på bioinformatiske verktøy.

 

Innhold

• Filtrering av data
• Design og mønstergjenkjenning
• Analyser av DNA- og protein-sekvenser
• Analyser av ekspresjonsmønstre
• Parvise og multiple sekvenssammenstillinger
• Proteinkarakterisering / analyser

Læringsutbytte

Etter fullført emne BIO127 Anvendt Bioinformatikk skal studenten kunne:

• Beskrive sentrale bioinformatiske verktøy og databaser
• Forklare grunnleggende prinsipper for utvalgte bioinformatiske analysemetoder

• Utføre grunnleggende bioinformatiske analyser
• Tilegne seg ny kunnskap og oppdatere seg om bioinformatiske verktøy
• Evne til kritisk tenkning og refleksjon rundt de muligheter og begrensninger som ligger i fagfeltet

• Planlegge og gjennomføre dataanalyser på et datamateriale ut fra en gitt problemstilling

Anbefalte forkunnskaper

BIO125 Cellebiologi, BIO120 Matematikk og BIO123 Statistikk.

Undervisnings- og læringsformer

Forelesninger.

Dataøvelser.

Alle studenter må ha egen bærbar datamaskin. Faget har sterkt innslag av datastøttet læring. Datastøtteprogrammet "It´s learning" benyttes i faget.

Obligatorisk læringsaktivitet

Fire obligatoriske dataøvelser. Alle dataøvelsene må være gjennomført til fastsatte frister og være godkjent før eksamen kan avlegges.

Dataøvelse 1-3 leveres inn elektronisk for godkjenning. Den fjerde Dataøvelsen utføres på et obligatorisk todagers Proteinseminar og skal ikke leveres inn. Tilstedeværelse og gjennomføring av Proteinseminaret oppfyller kravet til godkjent Dataøvelse 4. Dataøvelse 1-3 kan totalt leveres inn to ganger for godkjenning.

De fire godkjente dataøvelsene er gyldige seks påfølgende semestre.

Vurderingsform

Skriftlig digital skoleeksamen, 3 timer.

Eksamen vil bli avholdt på det digitale eksamenssystemet Wiseflow. Studentene må medbringe egen PC/MAC. Programvaren som er nødvendig for å gjennomføre eksamenen må være installert og testet før eksamensdagen.

Karakterskala: Bestått/Ikke bestått

Hjelpemidler ved eksamen

Datamaskin med tilgang til internett.

Mer om hjelpemidler